而就在美军进攻的“野猫”们和日军的“零式”在日军舰队不远处天空上鏖战的时候，此时正在进攻珍珠港的日军第二波的也差不多完成了轰炸，这个珍珠港内浓烟滚滚，一片狼藉。
尤其是美军珍珠港内停泊的那一艘“游骑兵号”航母，以及另外几艘战列舰，还有就是美军珍珠港附近的几处机场，比如惠勒机场和希甘姆机场等，这些都是日军主要轰炸的目标，此时已经被轰炸的不成样子。
具体战果还不清楚，但是日军看得很清楚，美军的“游骑兵号”航母在日军飞行员的特别照顾下，已经完全沉入海底，另外还至少有5艘战列舰也是同样的命运，美军的大部分机场都被瘫痪，炸毁的美军飞机无数。
但是此时第二波轰炸的日军也收到了舰队被美军发现，并遭到美军战机进攻的消息，命令他们立即返航，所以日军的这波进攻指挥官岛崎重合立即下达了撤退命令，他们第二波的轰炸已经完成的很完美了。
原来历史上日本在轰炸珍珠港时犯下了一个非常大的错误，那就是他们只轰炸了美军港内的船舰而没炸船坞，甚至连距离珍珠港5英里以外山上美军的油料库都没有轰炸。在当时的情况下，哪怕有一架日军战机飞到那里，就可以将它们炸得一滴不剩。
而如果珍珠港内美军的船坞被全部炸毁的话，美军仅存的船舰也将无处停泊，大量毁伤的船舰更是将无处修复。
而美国海军储存在珍珠港油料库可是足足有450万吨重油，如果真的被日军全部炸毁的话，那么美军太平洋舰队剩余的所有船舰和飞机在未来很长一段时间里，都将变成动弹不得的一堆废铁。