此时这两个师作为国防军的先头部队已经登陆台湾，按说很快国防军的后续部队就会赶到，但是由于天气的缘故，台湾海峡暂时无法允许运兵船的通过，所以这两个师就变成了孤军深入敌人腹地，极度危险，万一被日军调集重军很容易被围歼，不过日军并没有对这两个师发起大规模攻击。
至于日军之所以没有主动进攻这两个师国防军，主要是托了台北地区兵力不足的福，这是因为在战争开打之前，日本驻台湾总督太田政宏就认为国防军的主攻方向一定是在台南地区，因为那里有个澎湖列岛，双方的战斗肯定会围绕澎湖列岛展开，这点他猜测的一点没错，双方都看出了澎湖列岛在这次战争当中的地位。
所以他制定了重南轻北的作战计划，将日军两个师团主力调集到台南地区，留下一个师团主力在台中地区，至于台北地区则是有许多台湾警察部队组成的杂牌军，不过台北因为距离日本琉球群岛机场很近，可以在极短的时间内得到来自琉球群岛机场的战机支援。
但是国防军这两个师在新竹地区登陆，让太田政宏心跳了一下，他赶紧命令留守台中地区的那个日军师团负责对付国防军这两个师，并且在考虑是否调集台南的一个日军师团北上，歼灭这支国防军部队呢？
但是此时澎湖列岛上激烈的战斗，让他迟迟下不了决心，所以这两个师的国防军部队孤军进入台湾后，竟然没有遭到日军的合围，逐渐让这两个师在新竹北部地区立足了。
国防军还在等台湾海峡天气转好，到时候国防军北方军区就会将基隆作为首选夺取的对象，等占领了基隆，切断了日军从北面接收来自日本本土的战争物资时，那时候国防军在台湾从北往南进攻日军，配合进攻台湾南部的国防军南方军区一举拿下整个台湾。
这些都是国防军制定的计划，所以这次叶寒率领的特战队的主要任务，就是摸清基隆的具体情况，为国防军拿下基隆做准备。